On the first login, identification is conducted with the root username and its usual password (or any user's login credentials which belongs to the sudo group). It is recommended to change the password used for webmin as soon as possible, so that if it is compromised, the server's user accounts will not be involved, even if this confers important administrative rights to the machine.

Beware! Since webmin has so many features, a malicious user accessing it could compromise the security of the entire system. In general, interfaces of this kind are not recommended for important systems with strong security constraints (firewall, sensitive servers, etc.), and they are not recommended to be exposed to the public either.

يقدم مشروع GNOME أيضاً عدة واجهات إدارة يمكن الوصول إليها عادة عبر مدخلة ”Settings“ من قائمة المستخدم في الزاوية اليمنى العليا. البرنامج gnome-control-center هو البرنامج الرئيسي الذي يجمع هذه الواجهات معاً لكن معظم أدوات الضبط التي تعمل على مستوى النظام متوفرة فعلياً في حزم أخرى (accountsservice،‏ system-config-printer، الخ). مع أن هذه البرامج سهلة الاستخدام، لكنها لا تغطي إلا عدداً محدوداً من الخدمات الأساسية: إدارة المستخدمين، ضبط الوقت، إعداد الشبكة، إعداد الطابعات، الخ.

تشترط سياسة دبيان صراحة وجوب اتخاذ جميع الإجراءات اللازمة للحفاظ على التعديلات اليدوية على ملفات الإعداد، لذلك يتزايد عدد السكربتات التي تتخذ الاحتياطات عند تحرير ملفات الإعداد. المبدأ العام بسيط: يُجري السكربت تعديلاته فقط إذا كان يعرف الحالة السابقة لملف الإعداد، ويتم التأكد من هذا بمقارنة checksum الملف مع checksum آخِر ملف مولد تلقائياً. إذا تطابقا، يُسمَح للسكربت بتعديل ملف الإعداد. وإلا، فإن السكربت يقرر أن الملف قد تعدّل ويسأل عما يجب فعله (تثبيت الملف الجديد، حفظ الملف القديم، أو محاولة دمج التغييرات الجديدة في الملف الحالي). لطالما تميزت دبيان بهذا المبدأ الوقائي، لكن التوزيعات الأخرى بدأت تتبناه تدريجياً.

يمكن استخدام البرنامج ucf (من حزمة دبيان ذات الاسم نفسه) لتطبيق مثل هذا السلوك.